Мэтай дзейнасці УП «Цэнтр экспертыз і выпрабаванняў у ахове здароўя» з'яўляецца правядзенне ў парадку, устаноўленым заканадаўствам Рэспублікі Беларусь, работ па забеспячэнні бяспекі, эфектыўнасці і якасці лекавых сродкаў, фармацэўтычных субстанцый, вырабаў медыцынскага прызначэння, медыцынскай тэхнікі, шляхам правядзення комплексу работ па падрыхтоўцы і экспертызе дакументацыі (у тым ліку правядзенне інспектавання вытворчасцей зарубежных вытворцаў), ажыццяўленне кантролю якасці лекавых сродкаў, аказанне кансультатыўнай дапамогі фармацэўтычным прадпрыемствам Рэспублікі Беларусь для іх падрыхтоўкі да планавых праверак або да сертыфікацыі вытворчасці лекавых сродкаў і (або) акрэдытацыі выпрабавальных лабараторый.